Back to database list

aed_malgae_pars

 See AED Science Manual aed_malgae_pars

!-- GENERAL parameters
p_name chaetomorpha cladophora cgm ulva ulva_a ulva_b ulva_c !- [string] Name of macroalgae group
p_initial  10   10   10   20   20   20   0  !- [real] Initial concentration of macroalgae (mmol C/m3)
p0  0.2   0.2   0.2   1.2   1.2   1.2   0  !- [real] Minimum concentration of macroalgae (mmol C/m3)
w_p  0   -0.07344   -0.07344   0   0   0   0  !- [real] sedimentation rate (m/d)
Xcc  300   50   0.25   50   50   50   50  !- [real] carbon to chlorophyll ratio (mg C/mg chla)
!-- GROWTH parameters
R_growth  0.6   0.8   0.6   0.7   0.7   0.7   0.7  !- [real] Phyto max growth rate @20C (/day)
fT_Method  1   1   1   1   1   1   1  !- [integer] Specifies temperature limitation function of growth (-); 0 = no temperature limitation 1= CAEDYM style
theta_growth  1.06   1.09   1.07   1.057   1.057   1.057   1.057  !- [real] Arrenhius temperature scaling for growth function (-)
T_std  18   23   12   20   20   20   20  !- [real] Standard temperature (deg C)
T_opt  22   30   22   25   25   25   25  !- [real] Optimum temperature (deg C)
T_max  28   39   35   35   35   35   35  !- [real] Maximum temperature (deg C)
!-- LIGHT parameters
lightModel  3   2   2   1   1   1   1  !- [integer] Type of light response function [0 = no photoinhibition; 1 = photoinhibition]
I_K  140   130   100   150   150   150   150  !- [real] Half saturation constant for light limitation of growth (microE/m^2/s) used if lightModel=0
I_S  390   1300   200   600   600   600   600  !- [real] saturating light intensity (microE/m^2/s) used if lightModel=1
KePHY  4.6667E-5   0.0004   0.0004   0.0004   0.0004   0.0004   0.0004  !- [real] Specific attenuation coefficient ((mmol C m^3^-1)^1 m^-1)
!-- RESPIRATION parameters
f_pr  0.025   0.025   0.025   0.025   0.025   0.025   0.025  !- [real] Fraction of primary production lost to exudation (-)
R_resp  0.07   0.17   0.151   0.05   0.05   0.05   0.05  !- [real] Phytoplankton respiration/metabolic loss rate @ 20 (degC)
theta_resp  1.04   1.06   1.06   1.047   1.047   1.047   1.047  !- [real] Arrhenius temperature scaling factor for respiration (-)
k_fres  0.6   0.5   0.25   0.7   0.7   0.7   0.7  !- [real] Fraction of metabolic loss that is true respiration (-)
k_fdom  0.1   0.7   0.3   0.9   0.9   0.9   0.9  !- [real] Fraction of metabolic loss that is DOM (-)
!-- SALINITY parameters
salTol  0   0   0   5   5   5   5  !- [integer] Type of salinity limitation function (-)
S_bep  1   3   2   0   0   0   0  !- [real] Salinity limitation value at maximum salinity S_maxsp (-)
S_maxsp  36   36   36   45   45   45   45  !- [real] Maximum salinity (g/kg)
S_opt  18   3   28   18   18   18   18  !- [real] Optimal salinity (g/kg)
!-- NITROGEN parameters
simDINUptake  1   1   1   1   1   1   1  !- [integer] Simulate DIN uptake (0 = false, 1 = true)
simDONUptake  0   0   0   0   0   0   0  !- [integer] Simulate DON uptake (0 = false, 1 = true)
simNFixation  0   0   0   0   0   0   0  !- [integer] Simulate N fixation (0 = false, 1 = true)
simINDynamics  0   0   0   1   1   1   1  !- [integer] Simulate internal N (0 = assumed fixed C:N, 2 = dynamic C:N)
N_o  0   0   0   1   1   1   1  !- [real] Nitrogen concentraion below which uptake is 0 (mmol N/m^3)
K_N  1.4143   3.2143   10   10   10   10   10  !- [real] Half-saturation concentration of nitrogen (mmol N/m^3)
X_ncon  0.0085714   0.068571   0.06857   0.034   0.034   0.034   0.034  !- [real] Constant internal nitrogen concentration (mmol N/ mmol C) used if simINDynamics = 0 or 1
X_nmin  0.10286   0.034286   0.03429   0.018   0.018   0.018   0.018  !- [real] minimum internal nitrogen concentration (mmol N/ mmol C) used if simINDynamics = 2
X_nmax  0.12857   0.068571   0.15   0.0676   0.0676   0.0676   0.0676  !- [real] maximum internal nitrogen concentration (mmol N/ mmol C) used if simINDynamics = 2
R_nuptake  0   0   0   0.208   0.208   0.208   0.208  !- [real] maximum nitrogen uptake rate(mmol N/m^3/d) used if simINDynamics = 2
k_nfix  2   2   2   0.7   0.7   0.7   0.7  !- [real] growth rate reduction under maximum nitrogen fixation (/day) used if simNFixation >0
R_nfix  0.0028571   0.017143   0   0   0   0   0  !- [real] nitrogen fixation rate (mmol N/mmol C/day)
!-- PHOSPHORUS parameters
simDIPUptake  1   1   1   1   1   1   1  !- [integer] Simulate DIP uptake (0 = false, 1 = true)
simIPDynamics  0   0   1   1   1   1   1  !- [integer] Simulate internal phosphorus dynamics (0 = assumed fixed C:P, 2 = dynamic C:P)
P_0  0.0645   0.0645   0.1   1   1   1   1  !- [real] Phosphorus concentraion below which uptake is 0 (mmol P/m^3)
K_P  0.12355   0.29032   4.03   5   5   5   5  !- [real] Half-saturation concentration of phosphorus (mmol P/m^3)
X_pcon  0.0003871   0.0030968   0.001   0.001   0.001   0.001   0.001  !- [real] Constant internal phosphorus concentration (mmol P/ mmol C) used if simIPDynamics = 0 or 1
X_pmin  0.0019355   0.00077419   0.00077419   0.00048   0.00048   0.00048   0.00048  !- [real] Minimum internal phosphorus concentration (mmol P/mmol C) used if simIPDynamics = 2
X_pmax  0.027097   0.0077419   0.00645   0.00216   0.00216   0.00216   0.00216  !- [real] Maximum internal phosphorus concentration (mmol P/mmol C) used if simIPDynamics = 2
R_puptake  0   0   2   0.00024   0.00024   0.00024   0.00024  !- [real] Maximum phosphorus uptake rate(mmol P/m^3/d) used if simIPDynamics = 2
!-- SILICA parameter
simSiUptake  0   0   0   0   0   0   0  !- [integer] Simulate Si uptake (0 = false, 1 = true)
Si_0  0   0   0   0   0   0   0  !- [real] Silica concentraion below which uptake is 0 (mmol Si/m^3)
K_Si  0   0   0   8   8   8   8  !- [real] Half-saturation concentration of silica (mmol Si /m3)
X_sicon  0   0   0   0.171   0.171   0.171   0.171  !- [real] Constant interal silica concentration (mmol Si/mmol C)